Back علم الوجود الجيني Arabic Gene Ontology Catalan Gene Ontology German Οντολογία Γονιδίων Greek Gene Ontology English Ontología génica Spanish هستیشناسی ژن Persian Gene Ontology French Gene Ontology Galician אונטולוגיית גנים HE
| Ontologija gena/Genska ontologija | |
|---|---|
 | |
| Skraćenica | GO |
| Datum osnivanja | 1998. |
| Vrsta | Biološka baza ontoloških podataka |
| Status | Aktivna |
| Glavno sjedište | Slobodni pristup |
| Članstvo | Globalno |
| Jezik | Engleski |
| Glavni organ | Konzorcij za ontologiju gena |
| Br. volontera | Neograničen |
| Veb-sajt | http://geneontology.org/ |
Ontologija gena (eng. Gene Ontology: GO) glavna je bioinformatička inicijativa za objedinjavanje zastupljenosti atributa gena i genskih proizvoda u svim vrstama.[1] Preciznije, cilj projekta je
- održavanje i razvoj svog kontroliranog rječnika gena i svojstava genskih proizvoda;
- označavanje gena i genskih proizvoda, te asimilacija i širenje podatke o bilješkama;
- pružanje alata za lahak pristup svim aspektima podataka predviđenih projektom i omogućavanje funkcionalne interpretacije eksperimentalnih podataka koristeći GO, naprimjer putem analize obogaćenja.[2][3] GO je dio većeg napora u klasifikaciji, Otvorene biomedicinske ontologije, jedan od prvih članova kandidata za OBO livnicu.[4]
Dok se označavanje gena fokusira na gene i genske proizvode, ontologija gena usredotočuje se na funkciju gena i genskih proizvoda. GO također proširuje napore koristeći jezik markiranja za izradu podataka (ne samo gena i njihovih proizvoda već i kuriranih atributa) mašinski čitljivih, i to na način koji je objedinjen u svim vrstama (dok se konvencije genske nomenklature razlikuju u zavisnosti od biološkog taksona).
- ^ The Gene Ontology Consortium (januar 2008). "The Gene Ontology project in 2008". Nucleic Acids Research. 36 (Database issue): D440–4. doi:10.1093/nar/gkm883. PMC 2238979. PMID 17984083.
- ^ Dessimoz, Christophe; Škunca, Nives, ured. (2017). The Gene Ontology Handbook. Methods in Molecular Biology. 1446. doi:10.1007/978-1-4939-3743-1. ISBN 9781493937431. ISSN 1064-3745. S2CID 3708801.
- ^ Gaudet, Pascale; Škunca, Nives; Hu, James C.; Dessimoz, Christophe (2017). "Primer on the Gene Ontology". The Gene Ontology Handbook. Methods in Molecular Biology. 1446. str. 25–37. doi:10.1007/978-1-4939-3743-1_3. ISBN 978-1-4939-3741-7. ISSN 1064-3745. PMC 6377150. PMID 27812933.
- ^ Smith B, Ashburner M, Rosse C, Bard J, Bug W, Ceusters W, Goldberg LJ, Eilbeck K, Ireland A, Mungall CJ, Leontis N, Rocca-Serra P, Ruttenberg A, Sansone SA, Scheuermann RH, Shah N, Whetzel PL, Lewis S (novembar 2007). "The OBO Foundry: coordinated evolution of ontologies to support biomedical data integration". Nature Biotechnology. 25 (11): 1251–5. doi:10.1038/nbt1346. PMC 2814061. PMID 17989687.
