Markus Jürgen Fischer (geboren 1965[1]) ist ein deutscher Lebensmittelchemiker, der seit 2006 Professor an der Universität Hamburg ist. Zu seinen Forschungsschwerpunkten zählt die Feststellung der Authentizität von Lebensmitteln mittels molekularbiologischer Techniken sowie der Massenspektrometrie. Im Bereich Biochemie beschäftigt er sich mit der Aufklärung von Biosynthesewegen, der Wirkstoffentwicklung sowie der Diagnostik von Krankheitserregern und der Ernährungsphysiologie.[2]